Un sistema de innovación tiene necesariamente las características de un sistema complejo y evolutivo. Estas son también las características del sistema de innovación brasileño que es heredero de instituciones seculares y que solo muy tardíamente, recibieron el incentivo de organizaciones dedicadas a reflexionar acerca de la formación de un verdadero sistema. El presente trabajo aborda dicho tema recorriendo de manera bastante sintética el hilo conductor histórico de la constitución de la FINEP, en su papel de pieza central del sistema brasileño de innovación, hasta un tiempo reciente en el que se produce la actualización de sus instrumentos de acción, incluidos los instrumentos de apoyo directo a las empresas con recursos no reembolsables.